Mưa có tác động đáng kể đến việc làm sạch bề mặt linh kiện, lượng mưa càng nhiều thì việc làm sạch càng kỹ lưỡng. Hiệu ứng này càng rõ rệt khi các linh kiện bị nghiêng, trong khi các linh kiện không bị nghiêng sẽ có hành vi không nhất quán.
Nước mưa không phải lúc nào cũng đủ để rửa trôi bụi bẩn.
Mưa tự nhiên chắc chắn giúp loại bỏ bụi bẩn, nhưng chỉ dựa vào mưa không phải lúc nào cũng đủ. Mặc dù các tấm pin có thể trông sạch sẽ sau cơn bão, nhưng mưa có thể để lại những cặn bẩn khó nhìn thấy ngay lập tức.
Nước mưa thường chứa một lượng nhỏ bụi bẩn và các hạt khác, có thể tích tụ ở những khu vực nước mưa không thấm đến đủ. Một lớp màng mỏng cặn bẩn này có vẻ không đáng kể, nhưng nếu tích tụ quá lâu, nó có thể làm giảm đáng kể hiệu suất của tấm pin mặt trời và thậm chí gây ra hiệu ứng tấm nóng, dẫn đến hư hỏng.
Ngoài ra, nước mưa kém hiệu quả hơn trong việc làm sạch các tấm pin mặt trời lắp theo chiều ngang.
Nước mưa không thể loại bỏ hiệu quả các vết bẩn cứng đầu hoặc bụi bẩn nặng.
Chỉ riêng nước mưa không thể rửa sạch phân chim và các vết bẩn cứng đầu, cần phải vệ sinh thủ công.
Mưa nhẹ và mưa rào rải rác có thể làm tình trạng ô nhiễm trầm trọng hơn, khiến bụi dễ tích tụ hơn.