Deszcz ma znaczący wpływ na czyszczenie powierzchni elementu, a większe opady prowadzą do dokładniejszego czyszczenia. Efekt ten jest wyraźniejszy w przypadku elementów skośnych, podczas gdy elementy nieskośne wykazują niespójne zachowanie.
Woda deszczowa nie zawsze wystarcza do wypłukania brudu.
Naturalne opady deszczu z pewnością pomagają w usuwaniu kurzu i brudu, ale poleganie wyłącznie na deszczu nie zawsze jest wystarczające. Chociaż panele mogą wyglądać na czyste po burzy, opady deszczu mogą pozostawić na nich osady, które nie są od razu widoczne.
Woda deszczowa zazwyczaj zawiera niewielkie ilości brudu i innych cząstek, które mogą gromadzić się w miejscach, do których woda deszczowa nie dociera w wystarczającym stopniu. Cienka warstwa takich pozostałości może wydawać się nieistotna, ale jeśli pozostanie, może znacznie obniżyć wydajność paneli słonecznych, a nawet wywołać efekt płyty grzewczej, prowadząc do ich uszkodzenia.
Ponadto woda deszczowa jest mniej skuteczna w czyszczeniu poziomo zamontowanych paneli słonecznych.
Deszczówka nie jest w stanie skutecznie usunąć trudnych plam ani ciężkiego brudu.
Sama woda deszczowa nie jest w stanie zmyć ptasich odchodów i uporczywych plam, które wymagają ręcznego czyszczenia.
Lekki deszcz i okresowe opady mogą nasilać zanieczyszczenie, ułatwiając gromadzenie się większej ilości pyłu.